基底节区包括：杏仁核、纹状体和屏状核三部分。
1. 杏仁核
杏仁核，又名杏仁体，呈杏仁状，是边缘系统的一部分。是产生情绪，识别情绪和调节情绪，控制学习和记忆的脑部组织，而且研究发现，幼儿自闭症似乎也与扩大的杏仁核有关。
2. 纹状体
纹状体是大脑基底神经节之一。纹状体包括尾状核和豆状核，此2核并不完全分隔，在前端腹侧是相连接的。豆状核又分为壳核和苍白球。尾状核和壳核在种系发生上是纹状体较新的结构，合称新纹状体。
3. 屏状核
屏状核位于壳的外侧并与壳等大的薄片状灰质。与壳之间以外囊相隔，功能不明。