生奶因为没有经过消毒处理，而且没法确保奶牛本身是否健康，容器、用具等是否卫生，以及运输过程中是否受到污染等，因而很容易受到来源于环境中的大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、假单胞菌、真菌等，以及源于动物体的布鲁氏杆菌、结核杆菌等人畜共患致病菌等的污染。
例如，喝了被布鲁氏菌污染的生奶，有可能患布鲁氏菌病，该病可引起持续发热、多汗、关节痛及肝脾肿大等，当进入慢性期，可能引发多器官和系统损害。所以不建议直接喝生奶，特别是对于儿童、老人、孕妇和免疫力低下的人来说，受到这些病菌感染的危险更大。目前国内外均有因为喝生奶而引起中毒的报道。
因此，生奶一定要经过充分的加热煮沸（至少5分钟）后才可以喝。当然，最保险的做法是，直接到超市里购买低温奶、常温奶等经过消毒灭菌处理的奶。