第二类疫苗，是指由公民自费并且自愿受种的其他疫苗。
1. 水痘疫苗。水痘病毒具有高度传染性，它的主要传播途径是空气飞沫传播，因此经常在幼儿园、小学中爆发。水痘可引起宝宝发烧及皮肤长水泡、脓泡，还可能造成肺炎、脑膜炎等并发症，或是并发细菌感染。目前预防水痘最理想的方法就是接种疫苗，婴儿满1周岁时接种1次。
2. B型流感嗜血杆菌混合疫苗(HIB疫苗)。目前世界上已有20多个国家将HIB疫苗列入常规计划免疫，B型流感嗜血杆菌主要是通过空气飞沫传播，一般来说5岁以下尤其是2个月～2岁的宝宝容易感染。它不仅会引起小儿肺炎，还会引起小儿脑膜炎、败血症、脊髓炎、中耳炎、心包炎等严重疾病，是引起宝宝严重细菌感染的主要致病菌。
3. 流感疫苗。流感病毒也具有高度的传染性，主要传播途径也是空气飞沫传播，因此也经常在幼儿园、小学中爆发。儿童感染流感之后容易引发肺炎、中耳炎和心肌炎等并发症。6～35个月的孩子对流感病毒的抵抗能力相对于大龄儿童更弱，在遇到流感流行的时候，更容易感染流感。但是流感病毒本身变异很快，因此需要每年接种1次流感病毒，而且流感本身是具有自限性的疾病，抵抗力较好的孩子能够自我痊愈。
4. 轮状病毒疫苗。轮状病毒是3个月～2岁婴幼儿秋天发生腹泻时最常见的病原菌。这个疫苗对宝宝的保护率在60%～70%左右，所以不能完全避免宝宝得病，但接种之后可以减轻宝宝腹泻症状，而且其副反应相对而言较小。
5. 其他肺炎疫苗。由于肺炎可以由多种细菌、病毒等微生物引起，因此单靠某种疫苗预防效果有限，所以目前市场上就有3种常见的肺炎疫苗：七价肺炎疫苗、23价肺炎疫苗和上面提到的HIB疫苗，其中前两者肺炎较为少见，但是一旦宝宝得了这两种肺炎，也会对健康带来较大的危害。