主要有两种保存方式，具体如下：
阴凉通风处保存
将百香果置于常温下保存是最常见的一种保存方法，首先可以将百香果表面的水分擦干，然后直接置于阴凉通风处保存即可，注意避免潮湿、避免阳光直射，在保存过程中，由于水分蒸发，它的表皮会慢慢变皱，但是并不代表它一定是坏了，应当从其果肉来辨别是否腐坏。一般这种保存方法可以保存约1周。
冰箱冷藏保存
百香果中中含有较多的水分及糖分，容易滋生细菌而腐坏变质，将其置于冰箱冷藏不仅可以抑制细菌的繁殖及滋生，延长无花果的保存时间，还可以保持百香果的新鲜度；先将百香果表皮水分擦干，然后分别用保鲜膜包好，再置于冰箱冷藏即可，注意温度不宜调的太低。一般可以保存两周左右。