影响细胞呼吸的因素有：内因和外因。内因是由遗传决定酶活性，同一生物不同生长发育时期呼吸速率不同，同一生物不同器官呼吸速率不同，不同生物呼吸速率不同。
外因有：
温度，细胞呼吸是由酶催化的一系列反应过程，因此细胞呼吸对温度的变化很敏感。在一定范围内，细胞呼吸随温度的升高而加快，但超过最适温度后，细胞呼吸将急剧减弱，直至停止。
氧气浓度，氧气促进需氧呼吸，抑制厌氧呼吸，在一定范围内呼吸强度随着氧气浓度升高而增大。
二氧化碳浓度，增加二氧化碳浓度对有氧呼吸有抑制作用。
水，在一定范围内细胞呼吸强度随含水量的升高而加强，随水量的减少而减弱。