商户提交微信支付申请需要经过以下四个步骤：
1. 填写初审信息，需选择此账号的经营类目，并描述经营内容，有特殊资质要求的类目，还需上传对应的资质文件资料。
2. 填写商户信息及设置商户功能，填写商户信息这一步需要准备《营业执照》《税务登记证照》《组织机构代码证照》《法人或业务经办人身份证》等基本资料，然后按照网页的引导进行填写和资料上传，填写商户设置这一步可以选择所需支付类型，并填写各支付方式下的开发配置项，审核通过后，商户会收到分别来自微信和财付通的邮件，获得正式的商户账号APPID和财付通商户号PartnerID，支付权限生效、并进入测试状态。
3. 签署合同，需在线下完成，商户下载协议后，盖章并寄回指定地址。
4. 发布产品，仅限于公众号支付，在产品开发已完成、合同已经寄回、保证金已经缴纳之后，可以提交发布申请，微信进行产品审核、通过后即向全量用户发布。