宝宝出生时，脑细胞会持续生长、分化，功能也越来越完备。孩子从只能躺着到慢慢会翻身、坐起来、站立，这些功能与发展都是大脑的皮质层在控制。大脑属于高功能器官，血流非常丰富，生病时，若身体某些器官的血流开始不顺畅，人体机制会优先将血流保存在大脑，使其他器官的血流减少，甚至牺牲掉其他器官以保存大脑。而大脑里的脑脊髓液与脑膜炎有关，由于体循环与脑脊髓液循环分属不同系统，两个系统隔着「血脑障蔽」做物质的交换。而血脑障蔽则是在出生3个月后才会发展完成，将大脑和体循环的血液、组织液等隔开。
由于未满3个月大的宝宝其脑脊髓液跟体内血液未完全隔开，细菌容易藉由血液、脑脊髓液跑到大脑中造成脑膜炎。一般成人，因为有血脑障蔽的保护，细菌无法进入大脑。而新生儿容易感染脑膜炎且危险性高，最主要的原因是此时宝宝的脑膜也尚未发展完全，尤其是未满1个月内的孩子，因为大脑与身体的血液有相通，只要受到细菌感染，就容易产生败血症，同时引起脑膜炎。