大部分的玛瑙都是不透明的，只有少数是微透明至半透明，所以对于玛瑙的打光，一般都是从玛瑙饰品的背面打透射光，然后才能借以观察到内部的一些大概纹理。
比如天然南红玛瑙的红色其实是由无数的朱砂点聚集而成的，因此用强光照射南红玛瑙时，就可以观察到无数的密集在一起的朱砂点，而染色的玛瑙内部没有朱砂点，因此在灯光下看不到朱砂点。
另外，南红玛瑙颜色越红，就意味着朱砂点越密集越多，所以透明度也就越差，打光时基本不透，或者只在边缘部分有透光的现象。
但是染色仿制的南红玛瑙，并不会出现颜色越红越不透的现象。
还有，因为玛瑙大多透明度差，因此我们在购买的时候必须要通过打灯，才能准确鉴别其内部是否有隐形横断纹、龟背纹以及蜂窝纹或柚子肉纹等，以此来判断玛瑙品质的优劣。
比如如果玛瑙内部含有大量的隐形横断纹，就意味着容易断裂。