1. 使用毛巾过后，皮肤脱落的角质会附着在上面，毛巾每使用3-4次就要清洁一次，最好1-2个月更换一次。置放的位置环境不同，需要清洁的频率也会有所差异，例如比较潮湿的浴室，清洗、更换毛巾的频率就要更加频繁，否则毛巾会容易滋生细菌或发霉。
2. 尽可能使用超过60°C的高温水烫洗，如果可以，将毛巾用沸水煮10分钟左右，再用清洁剂洗干净，杀死潜伏在毛巾上的细菌。不过要保证毛巾材质不会因此出现变化。
3. 可定期使用“生物性”清洁剂清洗，藉由酶分解附着的蛋白质、淀粉和脂肪等污渍。该法不适用于所有材质的毛巾，使用前应该先确认标签再进行清洁。
4. 每次使用或清洗后的潮湿毛巾，最好放在通风有光照的地方展开、晾干，但也需避免长时间暴晒。