摩托车证和c1合并后，还是一个证，总共还是12分，不管驾驶什么车违章，都还是从12分里面扣。根据《机动车驾驶证申领和使用规定》第五章机动车驾驶人管理，第一节记分，第六十五条规定：道路交通安全违法行为累积记分周期（即记分周期）为12个月，满分为12分，从机动车驾驶证初次领取之日起计算。即两证合一就12分，无论你是骑摩托或者开汽车违章，就扣这12分。
摩托车驾驶证和c1合并的办理：
手续很简单，带身份证和驾驶证还有两张一寸的白底照片去当地的驾管科转回来就行，合完后手里驾证的准驾车型就是：C1D。
摩托车驾证和c1合并后的驾龄：
驾龄分别计算，摩托车的算摩托车的，小车的算小车的。驾龄主要是用于增驾的，增驾B1要取得C1满3年以上，且前3个记分周期无记12分记录。
摩托车驾驶证和c1合并在一起多久能上高速：
摩托车禁止上高速，增驾C证准驾车型驾照，在获取准驾车型驾照实习期内可以上高速但必须持有同等或者以上准驾车型驾照且三年以上驾龄的驾驶员陪驾，实习期结束后才可单独上高速。