原因在于，辣椒中含有一种统称为辣素的辣椒碱，也正是因为这种辣椒碱，才能使辣椒吃起来特别辣，特别够味。在切辣椒的时候，辣椒中的这种辣素很容易就沾染在手部的皮肤上，刺激到皮肤，使皮肤上的一些微小血管扩张，进而会有发红、发热的现象产生。同时还会刺激到痛觉神经，也我们就会感觉到火辣辣的疼了。
简单的说，就是辣椒中的辣素使皮肤的神经末梢发生了一系列的化学反应，使我们感觉到烧手。
不过，即便被辣椒辣到手也无需特别担忧，因为辣椒碱可溶于乙醇和碱性溶液中，所以可以用酒精擦拭或者是用盐水浸泡来进行缓解。虽然用冷水能解决一时的痛楚，但是由于辣椒碱遇冷水不易溶解，因此泡冷水只治标不治本。
需要注意的是，当手被辣椒辣到之后千万不要揉眼睛或者是触摸身体的其他部分，以免产生一些不好的后果。