1. 报名不同：特岗教师一般由各省统一招考，每年只有一次；支教报名通常采用的是网上报名，报考人员在规定时间登陆当地人事考试网报名。
2. 考试内容不同：支教考试一般只包括两个科目：《职业能力测试》、《综合知识》，教材一般选用所报考省、市、县“三支一扶”考试专用教材；特岗笔试内容主要为教育理论知识和专业基础知识，一般没有指定使用教材。
3. 待遇不同：支教一般服务期为一年到三年，服务期间由中央财政给予生活补助、交通补贴。服务期被计算工龄。服务单位为志愿者提供住宿等生活必要条件；特岗教师三年服务期内没有编制，工资主要由国家财政拨款和县财政补助组成。
4. 优势不同：支教教师除了服务期间的各类补贴外，在服务期间可以兼职担任所在乡镇团委书记、学校及其他服务单位的管理职；特岗教师优势则更加明显，三年服务期满后，可按规定被推荐免试攻读教育硕士。