碳素、氮素、无机盐和维生素等是食用菌营养物质。
食用菌最重要的营养来源是碳源。
作为碳源，除少数的碳水化合物不能被利用之外，它们能利用自单糖到纤维素等各种复杂的碳水化合物，如：纤维素、葡萄糖、果糖、蔗糖、麦芽糖、半乳糖、糊精、淀粉、半纤维素、木质素、有机酸、某些醇类等。
此外，氮素是食用菌合成蛋白质和核酸必不可少的主要原料。
食用菌在营养生长及生殖生长阶段，所需要的氮源主要有蛋白质、氨基酸、尿素、氨、铵盐和硝酸盐等。
蛋白质必须经蛋白酶分解成氨基酸后才能被吸收，其他小分子氮素化合物菌丝体可直接吸收。