1. 顺反异构体的物理性质有所不同，并表现出一些规律性，其中较显著的有熔点、溶解度和偶极距。
反式异构体中的原子排列比较对称，分子能规则地排入晶体结构中，因而具有较高的熔点。
2. 顺式异构体是两个电负性相同的原子或原子团处在分子的同侧，而不像反式那样比较对称地排列，因而顺式分子的偶极距比反式大，为偶极分子，有微弱的极性，因此在水中的溶解度也就比较大。
3. 燃烧热是指一摩尔化合物完全燃烧生成二氧化碳和水所放出的热量。它的大小可反映分子能量的高低，所以常可作为有机物相对稳定性的根据。通常有机物越稳定，分子能量就越低，就具有较小的燃烧。
反式异构体的燃烧比顺式小，因而反式较顺式稳定。