南京门慢医保办理流程：
1. 南京对13类24种慢性病的患者慢性病门诊医疗费实行限额补助。慢性病患者可向用人单位(灵活就业人员向所在区社会保险经办机构)提出申请，领取并填写《南京市城镇职工基本医疗保险门诊慢性病准人申请表》(以下简称《门慢申请表》)。
2. 申请准入门诊慢性病的患者持《门慢申请表》(一式两份)及近一年来的病历、检查报告单原件，到三级定点医疗机构(其中：高血压Ⅱ、Ⅲ期，糖尿病1、2型可在二级定点医疗机构，活动性肺结核可在专科定点医疗机构)相关科室，由专科副主任以上医师按规定的准人标准进行认定。《门慢申请表》需经医务处(科)审核后加盖公章。患有两种及两种以上慢性病的患者，需分别进行准人认定。长期驻外及异地安置的人员可在当地三级医疗机构(居住在县城、乡村的参保人员可到当地县级医院)进行准入认定。
3. 慢性病患者将医疗机构认定审核后的《门慢申请表》及近一年来的病历、检查报告单原件交至用人单位，由用人单位加盖公章后统一报市医保中心。经市医保中心审核确认后，将准入的门诊慢性病人员申请表及上述原件一并反馈用人单位。