男性服用褪黑素的剂量通常不会有太多副作用，但如果服用过量，可能会引起嗜睡、头痛等不良反应。过量补充还会引起多梦、夜间易醒等症状，有时会导致长期抑郁，加重抑郁症状。有的还可能影响内分泌，导致内分泌失调，如男性性功能下降、不育等都是可能的。
褪黑素也称为松果体素，是人脑松果体分泌的一种物质，控制着人体的生物钟。随着年龄的增长，褪黑素的分泌减少，容易出现失眠多梦等症状。适当补充褪黑素有助于调节睡眠质量。一般来说，褪黑素的副作用比较小，因为它是人体自身分泌的一种激素，但如果长期大剂量服用，也会出现上述副作用，所以应该也要注意。