二套房按揭贷款申请和第一套会有一些不同，其具体说明如下：二套房贷款利率不低于贷款基准利率的1.1倍。大部分城市公积金贷款首付比例30%，商住房首付比例40%，利率执行二套房利率，基本不会低于9折，甚至是原利率。一般情况下，夫妻双方中只要有任何一方已经购买过房产，现在再购买的，都属于第二套房。
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二套房贷款利率较高有利于降低银行信贷风险。可以降低房地产价格的涨幅。降低投资房产的意愿，从而使高居不降的房价得到舒缓。缩小贫富差距。增进社会稳定。一般情况下商业银行要在人民银行公布的基准利率6.55的基础上上浮10%，也就是7.21%。根据国家规定，二套房房贷利率应是基准利率的1.1倍。商贷的基准利率为6.55%(10年期)，公积金贷款基准利率为4.5%。