1. 作用不同
草铵膦先杀叶，与草甘膦杀根不同，通过植物蒸腾作用可以在植物木质部进行传导，其速效性间于百草枯和草甘膦之间。
草甘膦异丙胺盐是非选择性芽后除草剂，对多年生深根杂草，一年颧二年生禾本科杂草和莎草有特效。
2. 分子式不同
草胺磷：分子式，C5H15N2O4P。
草甘磷异丙胺盐：分子式，C3H9N·C3H8NO5P。
3. 应用不同
草胺磷：用于果园、葡萄园、马铃薯田、非耕地等防治一年生和多年生双子叶及禾本科杂草，如鼠尾看麦娘、马唐、稗、野生大麦、多花黑麦草、狗尾草、金狗尾草、野小麦、野玉米、鸭芽、曲芒发草、羊茅等等。
草甘磷异丙胺盐：通常用于玉米、棉花、大豆田和果园中，并可用于非耕地除草。