二套房缴纳的房产税计算方式如下：
1. 二手房若是正常过户的话，按相关规定则需要缴纳以下费用：增值税：税率5．55％，由卖方缴纳，同时规定。若是转让出售购买时间不足2年的非普通住宅，需按照全额征收增值税。若是转让出售购买时间超过2年的非普通住宅或者转让出售购买时间不足2年的普通住宅，需按照两次交易差价征收增值税。若是转让出售购买时间超过2年的普通住宅，则免征增值税。如果所售房产是非住宅类如商铺、写字间或厂房等，则不论证是否过2年都需要全额征收增值税。
2. 个人所得税：税率交易总额1％或两次交易差的20％，由卖方缴纳征收有两个条件：家庭唯一住宅以及购买时间超过5年。如果两个条件同时满足可以免交个人所得税；任何一个条件不满足都必须缴纳个人所得税；另外如果所售房产是非住宅类房产则不管什么情况都要缴纳个人所得税。
3. 印花税：税率1％，买卖双方各半，不过至今国家暂免征收。契税：基准税率3％，优惠税率1．5％和1％，由买方缴纳，同时规定。