萧山机场国内出发是B航站楼，位置正中偏北，其到达的出口有四号门、五号门、六号门。国内到达的四号、五号或六号门处，只需要面向南，往前走100-300米，就可以走到国际到达。
国际航站楼分出发层和到达层，总面积9.6万平方米，设计年旅客吞吐量为384万人次，高峰小时1020人次。出发层设两个值机岛，共有值机柜台48个，安检通道9个，边防检查通道12个；到达层设置边防检查通道14个。国际航站楼飞行区站坪及道面面积22.66万平方米，停机位18个，其中廊桥机位8个，远机位10个。8个廊桥中，还特别配置了一座空客380飞机的专用廊桥。航站楼配备了离港、信息集成、计算机网络、航班显示、泊位引导、安检信息管理、安防监控、调度通讯、行李处理、公共广播等10多套系统，内有2000平方米的免税购物区。